乾符四年（877）正月，朱阿三兄弟俩历尽艰辛，终于找到了起义军。王仙芝和黄巢联手，正招兵买马，准备进攻蕲、黄一带。见阿三兄弟俩牛高马大的，似乎有几分气力，义军小头目没搞什么政审便登记注册，让他俩成了起义军中的正式成员。
打仗的时候，朱阿二很看重自己的小命，冲锋陷阵时喊声最大的是他，跑得最慢的也是他。可抢钱抢女人的时候，他可不含糊，动作最快，下手最狠。在一次战斗中，他抢了个妓女做老婆，用抢到的钱在离军营不远的地方买了几间房子，偷偷地过起小家庭火绳。朱阿三则不同，非常卖力，冲锋陷阵毫不含糊，没多久便升为小队长。
别小看这个小队长职位，明太祖朱元璋投奔起义军后，当的第一个官就是九夫长，管九个人的小队长。
就在年前，在争夺蕲、黄的战争中，起义军不小心捉住了汝州刺史（今河南）王镣。王镣可不是一般的刺史，是诗人，更是当时负责镇压起义军全盘工作的当朝宰相王铎的堂弟。
听说堂弟被起义军抓了，王铎急忙托蕲州（今湖北蕲县南）刺史裴渥与起义军谈判，愿意有条件放了他弟弟。
裴渥急忙向起义军传话，只要放了王镣，当朝宰相可以给官给他们做。
听说只要放人就有官当，王仙芝觉得可以考虑。二月初，他带着黄巢去蕲州城与裴渥谈判。朱阿三兄弟俩也去了，职责是和其他同去的弟兄保护主帅的安全。
王仙芝一行人到了蕲州城下，并没看到想象中的热烈欢迎画面，而是城门紧闭。
喊了一通话之后，城门终于开了，吊桥也放了下来。
“慢！”王仙芝正欲策马进城，黄巢忙伸手拦住。见敌人如此小心，倒给了黄巢一个提醒。“要是敌人来个关门打狗，把城门关了，我们还不成了他们的下酒菜？”
比方虽不好听，可很形象，把王仙芝吓了一跳。他忙勒住马，挥手示意队伍停下来。
见王仙芝他们不动了，裴渥倒是焦急，连忙派人出城去请，说大肉大鱼就摆在城楼上，等义军首领大驾光临。
“不行，要是你们背后捅刀子，怎么办？谈判地点得由我方来定，人数双方不得超过十人。”黄巢冲官方来使大声宣布，提出具体要求。
官方来使急忙回去传话，裴渥听了，直骂义军狡诈，不好对付，可又不得不依从。地点选哪儿为好呢？他们防备我们，我们也得防备他们。
他站到城楼，放眼一看，见城门的右侧有个小山包，觉得那个地方是个谈判的好地方。裴渥又派人传话，说谈判地点可以改到城外的那个小山包，其它地方他不同意。
王仙芝觉得那个小山包也可以，便答应下来。
义军百多人驻扎在小山包的南侧，官兵百多人驻扎在小山包的北侧，双方首领各带十人在山头谈判。
裴渥担心谈判冷场，命手下人把城头的酒菜搬到小山包上，一边喝酒一边谈判，在和谐的气氛中谈判效果可能好些。
喝了几轮酒后，在争吵声中，王仙芝与裴渥终于达成了共识：放了王镣，授王仙芝左神策军押牙一职（禁军中管仪仗侍卫的小头目）。
对这个谈判结果，王仙芝很满意，一抹嘴巴，起身招呼黄巢回去。
黄巢没动，他在等下文，可没有任何下文。
王仙芝以为他贪吃，舍不得桌上的肥肉，于是上前扯了他一下。
黄巢一挣，大骂起来。
“我和你共立誓言，当横行天下，为天下老百姓谋福利。现在你倒好，当了官走人，我们五千人怎么办？”
说完，他一拳过去，击中王仙芝的头部，打得他头破血流。
“反对，反对。”黄巢骂人，跟随去的义军兄弟听到了；黄巢打人，跟随去的意义军兄弟也看到了。他们响应黄巢，齐声吆喝起来。朱阿三站在山下，也随着其他弟兄聒噪起来。
王仙芝慌了，不敢做声，灰溜溜地随黄巢他们回沂州（今山东临沂市）营地。裴渥目瞪口呆地站在小山包上，看着王仙芝他们从容离开。王镣还在他们手中，他不敢下令去追。
回到营地，王仙芝和黄巢分道扬镳，各奔前程。三千人跟随王领导，二千人跟随黄领导。
敢和主帅叫板的人，朱阿三佩服。他坚决跟了黄巢，朱存坚决跟弟弟。